科學家研究證實聲音的振動還能改變分子結構。18世紀六十年代，瑞士科學家Hans Jenny，經過十年的實驗測試得出聲音創造改變分子結構，人體細胞和器官也產生聲音，組成人體自己特殊的聲音。比如，柔緩的音樂能減慢心跳率，使人平靜。振動頻率對我們人體所有的原子，分子和細胞都能產生作用。和諧的聲音與整個身體共振，能使人體的振動與這個聲音諧調，從而達到和諧，平衡狀態。
1989年，美國的科學雜誌《21世紀》刊載了一位名叫沃倫•哈馬曼的人所寫的論文。論文中提到，如果將人體中的有機物質的頻率轉換成聲音，則相當於42個八度音。如果將最高頻率的標準定在八長調的”Do”的話，它就會高達570兆赫茲。而１赫茲表示１秒鐘波動１次，這也就是說，人體所產生的波動每秒鐘高達570兆次。換言之，人類其實隱含著超乎想像的能力。42個八度音的確令人難以想像，但這也說明著，人類擁有各種各樣的頻率波動。人體就是一個由不同頻率所組成的”宇宙”，只是依靠人體本身，就能演奏出一首恢弘的大宇宙交響曲。
日本的江本勝醫學博士曾做過實驗，自然、健康的水所帶有的頻率，會產生像雪花一樣的結構景象，而被污染的水所帶有的頻率，則會產生像泥漿一樣的形狀。聲音能改變這些形狀。和諧的聲音以及一些音樂，如古典音樂等能使污水產生像雪花一樣的形狀。有趣的是他也證明了心念也是有頻率的，譬如對著水說謝謝等正面字句，但是如果對水說殺了你、我討厭你等負面字句，水的結晶就會呈現混亂的形狀。即使是在瓶子上貼上標籤，也會有類似的效果。
而人體70%以上是由水組成的，甚至骨頭和骨髓的25%都是水。聲音在水中比在空氣中的傳播速度要快四倍，因此身體若跟著正面頻率進行共振，則能夠幫助我們治療身心疾病。若跟著負面頻率共振，則會有不良的影響。
聲音療法主要是通過生理和心理兩個方面的途徑來治療疾病。一方面，聲波頻率會引起人們生理上的反應。聲音的振動頻率是一種物理能量，而適度的物理能量會引起人體組織細胞發生和諧共振現象，能使顱腔、胸腔或某一個組織產生共振，這種聲波引起的共振現象，會直接影響人的腦電波、心率、呼吸節奏等。另一方面，聲波頻率也會引起人們心理上的反應。和諧的聲音波能提高大腦皮層的興奮性，可以改善人們的情緒，激發人們的感情，振奮人們的精神。同時有助於消除心理、社會因素所造成的緊張、焦慮、憂鬱、恐怖等不良心理狀態，提高應激能力。
現代聲音治療先驅者之一，強納森.高曼在他的「聲音治療的七大秘密」一書中也提到，人體也是一個振動源，人體的每一個器官，骨頭，組織以及各個生理系統都有它自己的振動頻率。這些頻率加起來就組成了人的振動頻率。人就像一個交響樂隊一樣，只要身體的一部分振動不和諧，身體就會出狀況。所以，當人體振動失調，或者某一部位振動失衡，跟著人體也會出現一些症狀，慢慢就產生了疾病。而聲音治療的原理在於聲音振動進入人體後，它能改變人體的振動頻率，使身體與之共振，改變失衡部位的振動頻率，使身體重新回到平衡狀態。當聲音頻率傳入人體，人的生物節律得到調節後，組織細胞發生和諧的同步共振後，各個組織系統就處於一種良好的運動狀態，如心率快慢、呼吸節奏、脈搏起伏、胃腸蠕動，甚至肌肉收縮舒脹都收到良好的調節；和諧的聲波對中樞和內分泌系統是一種良性刺激，促進神經內分泌系統分泌出有益於健康的激素、酶類、乙醯膽鹼等生命活性質，促進人體的新陳代謝。
聲音療法還能夠減輕或消除身體的緊張，緩解各種疾病，比如：頭痛、胃痛等。同時，它還能夠刺激腺體分泌腺液抵抗病菌感染；當神經系統處於疾病的重壓下時，聲音療法還能夠讓神經系統平靜下來。身體跟心理是相互依存，相互影響的。聲音能讓身體的細胞、腺體、器官以及各個循環系統高效運轉，人的神經系統一旦正常發揮其功能，全身就會隨之處於放鬆狀態，呼吸自然更為暢快；人的大腦一旦保持了清醒，感情就會得到昇華，也就可以擺脫消極情緒的困擾。
紐約腫瘤醫學博士米切爾蓋諾認為，聲音治療是最有效的綜合性的治療方式之一，聲音不僅能幫助治療重病患者，還能治療慢性疾病。他結合各種不同的聲音治療技術為他的癌症腫瘤病患治療，包括靜坐冥想、水晶鉢，西藏頌缽治療等。他每天都見證了聲音治療的神奇力量。
聲音除了能夠治療疾病外，它對人的心理和精神層面也有影響。人們也會用聲音來幫助冥想、打坐、靜心、釋放壓力、淨化心靈等。當今社會節奏越來越快，人們的壓力也越來越大，大部分人心理和精神過於壓抑，如果這些情緒長期得不到適當的發洩與釋放，久而久之人就會產生心理和精神疾病。如果這些疾病沒有得到及時的治療，這會嚴重影響人們的身體健康。
聲音治療能使人平靜下來，打開心靈，釋放壓力，緩解人們內心的焦慮，諧調內心，達到內心的寧靜與和諧。一旦我們的身體以一種正確、和諧的頻率振動，我們身心和諧統一時，我們才會變得更健康。
當我們振動和諧，身心平衡時，我們會感受到無限的愛，會對世界充滿了愛，同時我們也在向世界發出我們和諧的振動頻率。當越來越多的人向世界發出和諧的振動頻率時，世界也就充滿了愛和慈悲，從而世界就會更加和平，宇宙才會重新回到和諧統一的狀態。因此，聲音不僅能治療人類，它還能治療整個宇宙，整個世界。我們用聲音在治療自己的同時，也就是在治療宇宙。
聲音治療的工具有許多種，最常見的有音叉、西藏頌缽、水晶缽等。其他如棒鐘、搖鈴、金剛杵、行星鑼、手鼓和鐃鈸也可使用於聲音治療。另外，藍道瑪鍵盤則是運用畢達哥拉斯時代的智慧結合現代科技的結晶，堪稱新一代的聲音治療工具。